De 16-jarige Nanakusa brengt zijn alledaagse leven door op "Stairway Island", waar hij werd "weggegooid", samen met 2000 andere mensen, die allemaal de herinneringen misten aan de tijd net voordat ze daar aankwamen. De naam van het eiland is afkomstig van de lange trap die door het eiland loopt en zich uitstrekt tot aan de top van de berg waar de heks die het eiland regeert zou wonen. De enige manier om het eiland te verlaten, is door te vinden wat verloren is gegaan. Toch wil Nanakusa dit stilstaande eiland niet verlaten. Hij geniet daar van zijn leven.
Dat is totdat Manabe Yuu, zijn jeugdvriend, voor hem verschijnt en zijn nieuwe leven op zijn kop zet. Waarom werd Manabe Yuu, 's werelds meest optimistische persoon, weggegooid, en wie is de heks achter al deze mysterieuze gebeurtenissen? Volg Nanakusa en Manabe terwijl ze de ware aard van Stairway Island ontdekken.
